ВАК (Россия)
РИНЦ (Россия)
EBSCO
Регистрационное агентство DOI (США)
Ulrichsweb (Ulrich’s Periodicals Directory)
Scientific Indexing Services

Диагностика COVID-19. Способы и проблемы обнаружения вируса SARS-CoV-2 в условиях пандемии

DOI: https://doi.org/10.29296/25877305-2020-08-01
Номер журнала: 
8
Год издания: 
2020

Д.А. Кудлай(1, 2), доктор медицинских наук, профессор, Я.Е. Широбоков(3), Е.П. Гладунова(3),
доктор фармацевтических наук, профессор, Е.А. Бородулина(3), доктор медицинских наук, профессор (1)Первый
МГМУ им. И.М. Сеченова Минздрава России (Сеченовский Университет) (2)Государственный научный центр «Институт
иммунологии» ФМБА России, Москва (3)Самарский государственный медицинский университет E-mail:
borodulinbe@yandex.ru

По мере того, как продолжается пандемия COVID-19 и тестирование на SARS-CoV-2 становится все более доступным, появляются новые вопросы и проблемы в отношении нового вируса. Когда проводить тестирование? Кого тестировать? Как часто? И что делать с полученными результатами? Какие виды тестов имеются сейчас в наличии, и при каких обстоятельствах они могут оказаться полезными? Понимание вопросов организации тестирования на местном, региональном, государственном и национальном уровнях позволит оптимизировать проведение тестирования. В статье проведен обзор имеющихся тестов и то, как они могут быть полезны в условиях быстро меняющейся и никогда ранее не существовавшей ситуации.

Ключевые слова: 
инфекционные заболевания
лабораторная диагностика
COVID-19
тестирование на SARS-CoV-2

Для цитирования
Д.А. Кудлай, Я.Е. Широбоков, Е.П. Гладунова, Е.А. Бородулина Диагностика COVID-19. Способы и проблемы обнаружения вируса SARS-CoV-2 в условиях пандемии . Врач, 2020; (8): 5-10 https://doi.org/10.29296/25877305-2020-08-01


Список литературы: 
  1. Самородская И.В., Ларина В.Н., Назимкин К.Е. и др. Организационные и клинические проблемы диагностики COVID-19 на амбулаторном этапе. Врач. 2020; 31 (5): 23–30 [Samorodskaya I., Larina V., Nazimkin K. et al. Organizational and clinical problems of outpatient COVID-19 diagnostics. Vrach. 2020; 31 (5): 23–30 (in Russ.)]. https://doi.org/10.29296/25877305-2020-05-05
  2. Сascella M., Rajnik M., Cuomo A. et al. Features, Evaluation and Treatment Coronavirus (COVID-19). StatPearls: StatPearls Publishing, 2020. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK554776/
  3. Sullivan P.S., Sailey C., Guest J.L. et al. Detection of SARS-CoV-2 RNA and Antibodies in Diverse Samples: Protocol to Validate the Sufficiency of Provider-Observed, Home-Collected Blood, Saliva, and Oropharyngeal Samples. JMIR Public Health Surveill. 2020; 6 (2): e19054. DOI: 10.2196/19054
  4. Sanduzzi A., Zamparelli S.S. Nasopharyngeal and oropharyngeal swabs, and/or serology for SARS COVID-19: What are we looking for? Int J Environ Res Public Health. 2020; 17 (9): 3289. DOI: 10.3390/ijerph17093289
  5. Testing for COVID-19 | CDC [Electronic resource]. URL: https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/symptoms-testing/testing.html (accessed: 19.07.2020).
  6. Interim Guidelines for Clinical Specimens for COVID-19 | CDC [Electronic resource]. URL: https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/lab/guidelines-clinical-specimens.html (accessed: 16.06.2020).
  7. Udugama B. et al. Diagnosing COVID-19: The Disease and Tools for Detection. ACS Nano. 2020; 14 (4): 3822–35. DOI: 10.1021/acsnano.0c02624
  8. Patel R. et al. Report from the American Society for Microbiology COVID-19 International Summit, 23 march 2020: Value of diagnostic testing for SARS–CoV-2/COVID-19. mBio. 2020; 11 (2): e00722-20. DOI: 10.1128/mBio.00722-20
  9. Winichakoon P. et al. Negative nasopharyngeal and oropharyngeal swabs do not rule out COVID-19. J Clin Microbiol. 2020; 58 (5): e00297-20. DOI: 10.1128/JCM.00297-20
  10. CDC. Updated Interim Guidelines for Collecting, Handling, and Testing Clinical Specimens from Persons Under Investigation (PUIs) for Coronavirus Disease 2019 (COVID-19). URL: https://www.cdc.gov/csels/dls/locs/2020/updated_interim_pui_guidelines_for_covid-19.html
  11. Wang X. et al. Comparison of nasopharyngeal and oropharyngeal swabs for SARS-CoV-2 detection in 353 patients received tests with both specimens simultaneously. Int J Infect Dis. 2020; 94: 107–9. DOI: 10.1016/j.ijid.2020.04.023
  12. Lin C. et al. Comparison of throat swabs and sputum specimens for viral nucleic acid detection in 52 cases of novel coronavirus (SARS-Cov-2)-infected pneumonia (COVID-19). Clin Chem Lab Med. 2020; 58 (7): 1089–94. DOI: 10.1515/cclm-2020-0187
  13. Pan Y. et al. Viral load of SARS-CoV-2 in clinical samples. Lancet. Infect Dis. 2020; 20 (4): 411–2. DOI: 10.1016/S1473-3099(20)30113-4
  14. Yang Y. et al. Evaluating the accuracy of different respiratory specimens in the laboratory diagnosis and monitoring the viral shedding of 2019-nCoV infections. medRxiv. 2020. https://doi.org/10.1101/2020.02.11.20021493
  15. Kashir J., Yaqinuddin A. Loop mediated isothermal amplification (LAMP) assays as a rapid diagnostic for COVID-19. Med Hypotheses. 2020; 141: 109786. DOI: 10.1016/j.mehy.2020.109786
  16. Старшинова А.А., Кушнарева Е.А., Малкова А.М. и др. Новая коронавирусная инфекция: особенности клинического течения, возможности диагностики, лечения и профилактики инфекции у взрослых и детей. Вопросы современной педиатрии. 2020; 19 (2): 123–31 [Starshinova A.A., Kushnareva E.A., Malkova A.M. et al. New Coronaviral Infection: Features of Clinical Course, Capabilities of Diagnostics, Treatment and Prevention in Adults and Children. Current Pediatrics. 2020; 19 (2): 123–31 (in Russ.)]. https://doi.org/10.15690/vsp.v19i2.2105
  17. Zhong L. et al. Detection of serum IgM and IgG for COVID-19 diagnosis. Sci China Life Sci. 2020: 1–4. DOI: 10.1007/s11427-020-1688-9
  18. Notomi T., Okayama H., Masubuchi H. et al. Loop-Mediated Isothermal Amplification Of DNA. Nucleic Acids Res. 2000; 28 (12): E63. DOI: 10.1093/nar/28.12.e63
  19. Treibel T.A. et al. COVID-19: PCR screening of asymptomatic health-care workers at London hospital. Lancet. 2020; 395 (10237): 1608–10. DOI: 10.1016/S0140-6736(20)31100-4
  20. Corman V.M. et al. Detection of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) by real-time RT-PCR. Euro Surveill. 2020; 25 (3): 2000045. DOI: 10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045
  21. Chu D.K.W. et al. Molecular Diagnosis of a Novel Coronavirus (2019-nCoV) Causing an Outbreak of Pneumonia. Clin Chem. 2020; 66 (4): 549–55. DOI: 10.1093/clinchem/hvaa029
  22. Lu R. et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet. 2020; 395 (10224): 565–74. DOI: 10.1016/S0140-6736(20)30251-8
  23. Castro R. et al. COVID-19: a meta-analysis of diagnostic test accuracy of commercial assays registered in Brazil. Brazilian J Infect Dis. 2020; 24 (2): 180. DOI: 10.1016/j.bjid.2020.04.003
  24. Bao L. et al. Lack of Reinfection in Rhesus Macaques Infected with SARS-CoV-2 Beijing Key Laboratory for Animal Models of Emerging and Remerging Infectious. bioRxiv. 2020. https://doi.org/10.1101/2020.03.13.990226
  25. Guan W. et al. Clinical characteristics of coronavirus disease 2019 in China. N Engl J Med. 2020; 382 (18): 1708–20. DOI: 10.1056/NEJMoa2002032
  26. Zhang W. et al. Molecular and serological investigation of 2019-nCoV infected patients: implication of multiple shedding routes. Emerg Microbes Infect. 2020; 9 (1): 386–9. DOI: 10.1080/22221751.2020.1729071
  27. Xiang J. et al. Evaluation of Enzyme-Linked Immunoassay and Colloidal Gold- Immunochromatographic Assay Kit for Detection of Novel Coronavirus (SARS-Cov-2) Causing an Outbreak of Pneumonia (COVID-19). medRxiv. 2020. https://doi.org/10.1101/2020.02.27.20028787
  28. Yu H-qiong, Sun B-qing, Fang Z-fu et al. Distinct features of SARS-CoV-2-specific IgA response in COVID-19 patients. Eur Respir J. 2020; In press. https://doi.org/10.1183/13993003.01526-2020
  29. Marimuthu Y., Nagappa B., Sharma N. et al. COVID-19 and tuberculosis: A mathematical model based forecasting in Delhi, India. Indian J Tuberc. 2020; 67 (2): 177–81. DOI: 10.1016/j.ijtb.2020.05.006
  30. Mohsen Rokni, Vida Ghasemi, Zahra Tavakoli. Immune responses and pathogenesis of SARS-CoV-2 during an outbreak in Iran: Comparison with SARS and MERS. Rev Med Virol. 2020; 30 (3): е2107. DOI: 10.1002/rmv.2107
  31. Временные методические рекомендации по оказанию противотуберкулезной помощи в условиях пандемии новой коронавирусной инфекции (COVID-19) от 28.04.2020 утвержденные президиумом Российского общества фтизиатров и президиумом Ассоциации фтизиатров. Режим доступа: [Электронный ресурс]. [Vremennye metodicheskie rekomendatsii po okazaniyu protivotuberkuleznoi pomoshchi v usloviyakh pandemii novoi koronavirusnoi infektsii (COVID-19) ot 28.04.2020 utverzhdennye prezidiumom Rossiiskogo obshchestva ftiziatrov i prezidiumom Assotsiatsii ftiziatrov. Rezhim dostupa: [Elektronnyi resurs]. (in Russ.)]. URL: http://phtiziatr.iopd.ru/images/Clinic_Recomend/Pril_597_290420.pdf
  32. Слогоцкая Л.В., Синицын М.В., Кудлай Д.А. Возможности иммунологических тестов в диагностике латентной туберкулезной инфекции и туберкулеза. Туберкулез и болезни легких. 2019; 97 (11): 46–58 [Slogotskaya L.V., Sinitsyn M.V., Kudlay D.A. Potentialities of immunological tests in the diagnosis of latent tuberculosis infection and tuberculosis. Tuberculosis and Lung Diseases. 2019; 97 (11): 46–58 (in Russ.)] DOI: 10.21292/2075-1230-2019-97-11-46-58
  33. Foudeh A.M. et al. Microfluidic designs and techniques using lab-on-a-chip devices for pathogen detection for point-of-care diagnostics. Lab on a Chip. Royal Society of Chemistry. 2012; 12 (18): 3249–66. DOI: 10.1039/c2lc40630f